Το Σχολείο μας ιδρύθηκε το 1995.
Προέκυψε από τον χωρισμό του 3ου Γυμνασίου Τρικάλων σε 3ο και 9ο Γυμνάσιο Τρικάλων.
Στον ίδιο κτίριο συστεγάζονταν για περίπου 10 χρόνια και το 3ο Γενικό Λύκειο Τρικάλων, το οποίο από το 2004-2005 στεγάζεται σε νέο κτίριο στην οδό Μετεώρων στη συνοικία Γαρδικάκι.
Οι Διευθυντές του Σχολείου μας από την ίδρυση του έως σήμερα:
| ΣΧΟΛΙΚΑ ΕΤΗ | ΔΙΕΥΘΥΝΤΗΣ |
|---|---|
| 1995-1996 | Κωνσταντάκος Δημήτριος, Φιλόλογος |
| 1996-1997 | Φαγκρίδας Απόστολος, Μαθηματικός |
| 1997-2002 | Κωστούλας Νικόλαος, Φιλόλογος |
| 2002-2006 | Κωνσταντάκος Δημήτριος, Φιλόλογος |
| 2006-2007 | Κωνσταντάκος Δημήτριος, Φιλόλογος & Κέμος Γεώργιος, Μαθηματικός |
| 2007-2008 | Κέμος Γεώργιος, Μαθηματικός & Νταραμπέκης Αθανάσιος, Φιλόλογος |
| 2008-2009 | Νταραμπέκης Αθανάσιος, Φιλόλογος |
| 2009-2010 | Νταραμπέκης Αθανάσιος, Φιλόλογος & Οικονόμου Αχιλλέας, Θεολόγος |
| 2010-2011 | Οικονόμου Αχιλλέας, Θεολόγος |
| 2011-2013 | Γκουγκουλιάς Δημήτριος, Χημικός |
| 2013-2015 | Παπαδούλης Χρήστος, Πληροφορικής |
| 2015-2017 | Μπόλλης Λεωνίδας, Χημικός |
| 2017-2023 | Λιάκου Αριστείδης, Γεωλόγος |
| 2023-2024 | Ηλιάδη Αμαλία, Φιλόλογος |